Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms