Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk13Q69ZA1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms