Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cntn4Q69Z26 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms