Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CltcQ68FD5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms