Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms