Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VclQ64727 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VclQ64727 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VclQ64727 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VclQ64727 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VclQ64727 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VclQ64727 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms