Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc3Q64519 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Sdc3Q64519 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Sdc3Q64519 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Sdc3Q64519 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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