Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Irf4Q64287 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Irf4Q64287 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Irf4Q64287 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Irf4Q64287 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Irf4Q64287 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Irf4Q64287 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Irf4Q64287 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Irf4Q64287 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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