Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms