Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Phc1Q64028 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Phc1Q64028 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Phc1Q64028 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Phc1Q64028 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Phc1Q64028 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Phc1Q64028 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Phc1Q64028 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Phc1Q64028 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Phc1Q64028 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Phc1Q64028 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Phc1Q64028 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Phc1Q64028 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Phc1Q64028 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Phc1Q64028 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Phc1Q64028 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc1Q64028 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms