Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Col4a5Q63ZW6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms