Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sp4Q62445 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms