Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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