Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Supt6hQ62383 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Supt6hQ62383 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Supt6hQ62383 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Supt6hQ62383 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Supt6hQ62383 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Supt6hQ62383 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Supt6hQ62383 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Supt6hQ62383 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Supt6hQ62383 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Supt6hQ62383 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Supt6hQ62383 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Supt6hQ62383 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Supt6hQ62383 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Supt6hQ62383 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Supt6hQ62383 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Supt6hQ62383 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Supt6hQ62383 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms