Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SypQ62277 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SypQ62277 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SypQ62277 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SypQ62277 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SypQ62277 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SypQ62277 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SypQ62277 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SypQ62277 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SypQ62277 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SypQ62277 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SypQ62277 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SypQ62277 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SypQ62277 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SypQ62277 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SypQ62277 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SypQ62277 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SypQ62277 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SypQ62277 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SypQ62277 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SypQ62277 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SypQ62277 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SypQ62277 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SypQ62277 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SypQ62277 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SypQ62277 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SypQ62277 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SypQ62277 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SypQ62277 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SypQ62277 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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