Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms