Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sema3bQ62177 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sema3bQ62177 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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