Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms