Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hes3Q61657 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms