Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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PcolceQ61398 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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PcolceQ61398 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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PcolceQ61398 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PcolceQ61398 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PcolceQ61398 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PcolceQ61398 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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