Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms