Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JrkQ60976 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms