Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RelnQ60841 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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RelnQ60841 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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RelnQ60841 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RelnQ60841 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RelnQ60841 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RelnQ60841 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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RelnQ60841 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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RelnQ60841 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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RelnQ60841 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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RelnQ60841 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RelnQ60841 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms