Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms