Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgaeQ60677 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms