Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Satb1Q60611 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms