Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms