Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms