Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms