Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtp3Q5QGU6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms