Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms