Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms