Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms