Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Spag9Q58A65 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms