Protein–RNA interactions for Protein: Q562E2

Kctd19, BTB/POZ domain-containing protein KCTD19, mousemouse

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd19Q562E2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd19Q562E2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms