Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms