Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms