Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syne3Q4FZC9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms