Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms