Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms