Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms