Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms