Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms