Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms