Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms