Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms