Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms