Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms