Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms