Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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